Praegu koolimajana kasutatav kirikla on ehitatud 19. sajandi lõpus. Algaastaist tänaseni on Ruhnu kool olnud tava õppekavaga, kus erinevatel perioodidel on olnud erinevaid rõhuasetusi. Kooli teeninduspiirkonnaks on Ruhnu vald.